Rad u Zakladi organiziran je u Stručnoj službi kojom koordinira upravitelj Zaklade. U Stručnoj službi Zaklade obavljaju se sljedeći poslovi koji se odnose na operativni i programski rad Zaklade:

• poslovi upravljanja Zakladom
• poslovi vođenja ureda Zaklade
• poslovi spisovodstva i pismohrane
• financijski i računovodstveni poslovi   
• poslovi vezani za programe podrške
• poslovi vezani za istraživačke, razvojne i edukacijske programe te strateška partnerstva

Stručnu službu čine četiri jedinice:

• Ured upravitelja
• Samostalna jedinica za financije i računovodstvo
• Odjel za programe podrške i
• Odjel za istraživanje i razvoj