Upravni odbor

Upravni odbor Zaklade ima pet članova koje imenuje Vlada Republike Hrvatske na prijedlog ministra kulture na mandat od četiri godine, s pravom ponovnog imenovanja, a svi članovi obavljaju svoje funkcije bez naknade.

Upravitelj

Upravitelja Zaklade imenuje i razrješava Upravni odbor većinom članova, a odluka se donosi na temelju provedenoga javnog natječaja. Mandat upravitelja Zaklade traje četiri godine, s pravom ponovnog imenovanja.

Stručna služba

Zaklada djeluje kroz Stručnu službu čijim radom upravlja upravitelj Zaklade. Na temelju Poslovnika o ustrojstvu i radu Stručne službe Zaklade "Kultura nova" rad Stručne službe organiziran je u četiri jedinice s pripadajućim poslovima:

• Ured upravitelja u kojem se obavljaju poslovi vezani za upravljanje Zakladom, poslovi vođenja ureda Zaklade te poslovi vođenja spisovodstva i pismohrane.
• ​Samostalna jedinica za financije i računovodstvo u kojoj se obavljaju financijski i računovodstveni poslovi.
• Odjel za programe podrške u kojemu se obavljaju poslovi vezani za vođenje programa podrške te
• Odjel za istraživanje i razvoj u kojemu se obavljaju poslovi vezani za Zakladine razvojne, istraživačke i edukacijske programe i projekte te strateška partnerstva.

Pomoćna tijela i vanjski suradnici

Zaklada također imenuje pomoćna tijela, kao što su Povjerenstvo za procjenu kvalitete prijava pristiglih na javne pozive Zaklade, druga stalna i/ili povremena pomoćna tijela i radne grupe za obavljanje poslova iz djelokruga Zaklade koja se osnivaju odlukom Upravnog odbora odnosno, u slučaju operativnih poslova, odlukom upravitelja Zaklade. Osim toga, Zaklada razvija bogatu mrežu vanjskih suradnika s kojima surađuje na pripremi, provedbi i praćenju programa podrške te u okviru svoga operativnoga djelovanja u osmišljavanju i realizaciji različitih istraživačkih i razvojnih programa i projekata.